по шляху типу C:\Users%username% в файлі .gitconfig потрібно:

додати в кінці:

[difftool "vsdiffmerge"]
     path = C:/Program Files (x86)/Microsoft Visual Studio 14.0/Common7/IDE/vsdiffmerge.exe
     cmd = \"C:/Program Files (x86)/Microsoft Visual Studio 14.0/Common7/IDE/vsdiffmerge.exe\" \"$LOCAL\" \"$REMOTE\"
[mergetool "vsdiffmerge"]
     path = C:/Program Files (x86)/Microsoft Visual Studio 14.0/Common7/IDE/vsdiffmerge.exe
     cmd = "\"C:/Program Files (x86)/Microsoft Visual Studio 14.0/Common7/IDE/vsdiffmerge.exe\" /m \"$REMOTE\" \"$LOCAL\" \"$BASE\" \"$MERGED\" "

тільки вкажіть правильний шлях до visual studio

і на початку файлі вкажіть ніж ви будете

[merge]
     tool = vsdiffmerge
[diff]
     guitool = vsdiffmerge